1950年6月29日，中央人民政府颁布《中华人民共和国工会法》。1951年5月15日，第一届中国教育工会云南大学委员会（以下简称云南大学工会）由教授会、讲师助教会、职员联谊会、工警联谊会选举产生。60多年来，在上级工会和学校党委的领导、校行政的支持下，云南大学工会围绕一条主线——服务学校中心工作，突出两个重点——民主管理、凝心聚力，强化“三性”要求——政治性、先进性、群众性，履行四大职能——维护、建设、参与、教育，推进五个方面的工作——全面服务、终身关爱、重点维权、延伸亲情、职业发展，动员和组织广大教职工投身学校的各项事业，为学校的建设和发展做出了应有的贡献。先后被授予全国民主管理先进单位、全国模范职工之家、全国厂务公开先进单位（2次）、全国教科文卫体系统先进工会组织、全国巾帼文明岗（2次）、全国工人先锋号、全国教科文卫体系统先进女职工组织、云南省五一劳动奖状。
目前，云南大学共有工会会员5400多人（包括在编会员和非编会员）。全校有院级工会组织41个。校工会设有工会委员会、经费审查委员会、女职工委员会、提案工作委员会、劳动争议调解委员会；有组织部、宣传部、文体部、财经福利部等办事机构。教职工俱乐部包含11个文体协会。
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